Обычно в электронной коммерции на выбор влияют не сами возможности той или иной системы (платной или бесплатной), обеспечивающей деятельность работы интернет-магазина, а как раз наоборот — выбор упирается в то, с какими бизнес-решениями она должна справляться. А вот далее, когда становится отчетливо понятна задача интернет-магазина, начинается «с нуля» поиск наиболее оптимального решения. При этом под оптимальностью понимается совокупность дешевизны (желательно бесплатно) и качества решения.
Если считать, что создание интернет-магазина бесплатно — это создание сайта, не требующее явных финансовых вложений в виде покупки продукта или оплаты чьих-либо услуг, то и такие варианты присутствуют. Раз Вы задались таким вопросом, то вы не веб-мастер и не разработчик, поэтому сразу отметаем варианты собственной разработки (доработки) под свои нужды. Представим, что вы обычный пользователь интернета с большим желанием создать собственный интернет-магазин с нуля.